Objekt-Metadaten

Mason
Holtgrewe, Manuel ;  Universität <Berlin, Freie Universität> / Fachbereich Mathematik und Informatik

HaupttitelMason
Titelzusatza read simulator for second generation sequencing data
AutorHoltgrewe, Manuel
Institution/KörperschaftUniversität <Berlin, Freie Universität> / Fachbereich Mathematik und Informatik
Seitenzahl18 S.
Schriftenreihe Freie Universität Berlin, Fachbereich Mathematik und Informatik : Ser. B, Informatik ; [20]10,06
Freie Schlagwörterread mapping; second generation sequencing; simulation
DDC005 Programmierung, Programme, Daten
ZusammenfassungWe present a read simulator software for Illumina, 454 and Sanger reads. Its features include position specific error rates and base quality values. For Illumina reads, we give a comprehensive analysis with empirical data for the error and quality model. For the other technologies, we use models from the literature. It has been written with performance in mind and can sample reads from large genomes. The C++ source code is extensible, and freely available under the GPL/LGPL.
Dokumente
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Fachbereich/EinrichtungFB Mathematik und Informatik
Arbeitsbereich/InstitutInsitut für Informatik
Erscheinungsjahr2010
Dokumententyp/-SammlungenBuch
SpracheEnglisch
Rechte Nutzungsbedingungen
Erstellt am29.09.2010 - 09:48:19
Letzte Änderung23.01.2014 - 16:21:39
 
Statische URLhttp://edocs.fu-berlin.de/docs/receive/FUDOCS_document_000000006687
Zugriffsstatistik
 

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